ČESKÁ UROLOGIE / CZECH UROLOGY – 1 / 2021

18 PŘEHLEDOVÝ ČLÁNEK Ces Urol 2021; 25(1): 17–26 SUMMARY Hrbáček J, Hanáček V, Čermák P, Morais D, Zachoval R. An introduction to the study of human urinary microbiome. The assumption of healthy urine being sterile has been contradicted recently when the existence of urinary microbiota (UM) was revealed. Extended quantitative urine culture is based on longer incu‑ bation times in a wide selection of diverse growth conditions; bacteria are detected even in samples reported as negative by the standard urine culture protocol. Next‑generation sequencing helps with taxonomic assignment of prokaryoticDNA fragments according to the sequence in hypervariable regions of the 16S rRNA gene. Human UM is composed of the phyla Proteobacteria, Firmicutes, Bacteroidetes and Actinobacteria . FemaleUM is dominatedby the genus Lactobacillus, male urotypes have not been assigned with certainty to date. Changes in UM have been associatedwith functional disorders of the genitouri‑ nary tract (lower urinary tract symptoms, urge urinary incontinence, neurogenic bladder dysfunction, chro‑ nic kidney disease), chronic pelvic pain syndrome, in‑ terstitial cystitis and evenwith urinary bladder cancer. UMmay potentially playmany a role; what they are is a matter of ongoing research. UMmight be a useful tool in the diagnostics and therapy of disease. KEY WORDS Extended quantitative urine culture, genitourinary system, human microbiome, next generation se‑ quencing. ……… ÚVOD Předpoklad absence jakýchkoli mikrooganismů ve zdravé moči je jedním z pilířů našeho oboru. Původ této myšlenky sahá do poloviny 19. století, kdy Louis Pasteur, John Lister a další výzkumníci v experimentech pozorovali zkalení moči vysta‑ vené okolnímu prostředí v důsledku pomnožení přítomných bakterií, zatímco moč v uzavřené zkumavce zůstala čirá (1). Koncentrace 10 5 mikro‑ organismů/ml moči jako hranice klinicky význam‑ né infekce močových cest (IMC) byla stanovena v 50. letech 20. století harvardským infektologem Edwardem Kassem na základě srovnání pacien‑ tek s akutní pyelonefritidou (n = 74) a 444 zdra‑ vých kontrol (1, 2). I přes omezenou velikost jeho výzkumného souboru a nepopiratelný pokrok v diagnostice uroinfekcí se prahová hodnota 10 5 používá i 60 let po svém zavedení, přestože řada prací i klinická praxe poukázaly na její úskalí (2). V poslednímdesetiletí se dogma o sterilitě zdra‑ vé moči otřáslo v základech díky objevu existence močovéhomikrobiomu (MM). Odhaduje se, že počet bakterií žijících v komensálním vztahu na povrchu i uvnitř našeho těla desetkrát převyšuje počet našich vlastních buněk (3). Teprve nedávno byl však v rámci Projektu lidskéhomikrobiomu (HumanMicrobiome Project, HMP) učiněn pokus o přesnější popis mik‑ robiálních populací žijících v lidském těle, konkrétně v ústní dutině, orofaryngu, na kůži, ve střevě a ve vagině (4). Následnými výzkumy bylo potvrzeno, že pro jednotlivé lokality našeho organismu exi­ stují typická složení bakteriálních populací a jejich změny (používá se termín eubióza a dysbióza) do‑ provázejí či mohou signalizovat různé patologické stavy včetně onkologických onemocnění (5). Pro soubor všech mikroorganismů (včetně virů a hub) přítomných v určité lokalizaci se v literatuře používá termínu mikrobiota, zatímco mikrobiom označuje soubor jejich genetické informace (bakteriální i vi‑ rové DNA, plasmidů atd.) (6). Někdy se oba pojmy volně zaměňují; v dalším textu budeme výraz mikro‑ biomužívat v širšímvýznamu zahrnujícím spektrum mikroorganismů a jejich fenotypických rysů v dané anatomické lokalitě. Z důvodů uvedených v prvním odstavci ne‑ byl urogenitální systém zahrnut do projektu HMP. V poslední dekádě se však objevily překvapivé výzkumy dokazující, že moč asymptomatických jedinců, nadto s negativním závěrem standardní kultivace, obsahuje plejádu mikroorganismů, o je‑ jichž přítomnosti jsme díky omezenýmmožnostem lidského poznání zatím neměli tušení. Cílem tohoto textu je přiblížit čtenářům–urologům dosavadní poznatky na poli výzkumu močového mikrobiomu (MM) a jejich potenciální aplikace v budoucnosti.