573
2435581226014562118176
Ces36967936014570127174
Urol38957936014578115180208
2022;41287936014562121178238261
26(4):44157936014561119152209239261
242–24947017936014562119175231286343402
ORIGINÁLNÍ3862207016996181224324367468561635735777
PRÁCE4677207016983165262348424
řetězové62489801313284117168212268317369
reakce101789801312981129174221272
(qPCR).131389801312782137198252280295
Párové1632898013152101132188237288
vzorky194589801314693149181228279
vždy224889801314793151200
z2472898013141
HMC2537898013167151213
a6241048013150
DMC6991048013179164227
byly9501048013169117140189
porovnány11631048013169129161218267326375434480
z16671048013153
hlediska1744104801316890143204226265311362
struktury2130104801315085117175221258316348400
bak‑25541048013170120166196
teriálního624119801313485117140188211268290351409
společenstva10571198013150109169192245295346404443478531581
a16621198013158
přítomnosti17451198013169101123157213303361420460495517
vybraných22861198013158111172204254312358406464
DNA6241348013171141204
virů.852134801315072104162179
Výsledky:7741493013568125172201259326383443470
Zařazeno12761498013161112145196242295355415
bylo17161498013171120144204
devět19451498013170124175228262
pacientů22321498013171122173196250310343402
(82659149801313891
mužů6241648013190147191249
a8971648013150
19711648013154
žena)1049164801314495153202228
průměrného1301164801316092150239292323382435493552
věku18771648013149101146204
49,721061648013153103117169
let,2299164801312376109128
z24511648013144
nichž2520164801315880128186230
u6241798013159
osmi7081798013168109199221
byla9541798013170118142192
provedena11711798013170102160209262324378437487
sekvenace16831798013150104151204257316366416468
bakteriálních21761798013170121167205257289313362385443466515574
nukleových6241948013159116161185237296344396443501
kyselin1149194801314394134187210231288
a14611948013146
u15311948013155
sedmi1610194801313790150239260
qPCR18941948013156110172225
na21431948013155104
přítomnost2271194801315788111144200289346404444479
sedmi624209801314194154243265
běžných9132098013160114158217263310368
DNA13052098013171141203
virů.1532209801315072104162179
Bohatost17352098013155113172221253309349383
a21432098013149
diverzita2216209801315981130182214260283316366
mi‑26062098013189111144
krobiomu624224801314780136197219277367424
(alfa107222480131267294122173
diverzita)1269224801315779128180211257280313363389
HMC16822248013166151213
a19192248013147
DMC19902248013168153215
nebyla22292248013156109169216239288
stati‑2541224801313872122154176209
sticky62423980131417698146191243
významně8912398013156108155214262351409462
odlišná.13772398013165125148169208265314333
Struktura1734239801315889121179225261319350400
mikrobiálních21582398013197119164197254314337385407465486534592
komunit6242548013146101188243299320352
z9992548013139
HMC10612548013164146206
a12902548013145
DMC13582548013166148208
(beta1589254801312483135167215
diverzita)1827254801315475123173203248269301349374
vykázala2224254801314595140189232281302349
vět‑2596254801314595126154
ší624269801314162
podobnost7112698013163122182240301359417457492
v12272698013152
rámci1303269801313585174223244
jednoho1571269801312679139197255314372
pacienta,19672698013163113162184236294326376394
než23852698013161115159
byla25682698013163110134182
podobnost6242848013161120180238299357415455490
všech1138284801314686139189247
vzorků1409284801314692149181227285
HMC,17182848013166150212231
resp.1973284801312980120180197
všech2194284801314687139189247
vzorků2465284801314692149181227285
DMC.6242998013171156218237
Virová885299801315781113169217267
DNA11762998013173143206
byla14062998013162109133181
detekována16112998013162115148199244301350399457506
jak2141299801312574119
v22842998013151
HMC,23602998013170155217235
tak2619299801313686131
v6243148013150
DMC.6983148013171156218237
Závěr:7743293013563120174229269295
Výsledky10993298013156106147169222283329381
naší15043298013167116156178
pilotní1706329801316992114173205264286
studie2016329801314984142202224277
poukazují23173298013170129188233284329388410432
na6243448013160110
přítomnost7593448013169102125159217308367427468503
bakteriálního12873448013170121167205257289313362385444466527587
a18993448013159
virového1982344801315983115173222275334394
osídlení24013448013167108130190213267326349
horních6243598013159117149208230278335
močových9833598013191149198254302354402459
cest14663598013150100141175
u16653598013159
pacientů17483598013160110159181233291323381
s21533598013141
urolitiázou.2218359801315889146169191224246294339395453472
KLÍČOVÁ6253884014770132164236320392464
SLOVA11153884014763124208280352
Lidský624404801314972131170215267
mikrobiom,9154048013187108154187244304326384474492
horní14314048013156114146205226
močový16824048013187145194250298350
trakt,2056404801313163113158195214
virom,2294404801314770101157247265
led‑2583404801312073134167
vina,624419801315073130179197
močový8454198013190149198254302354
měchýř.12234198013190143193250296329340
ABSTRACT6254484014776146210275345425494562
Hrbáček7744648013171104167219269322369
J,1169464801314765
Hanáček12604648013180130190241292344392
V,1677464801316679
Tláskal1781464801316187137179226279302
V,2108464801316779
Saláková22124648013161113137187235294344396
M,26334648013197117
Čermák6244798013165118151245296344
P,993479801316873
Tachezy10924798013163107158218274320375
R,1492479801316890
Zachoval16074798013172124175236297347399423
R.2056479801316890
Profiling21724798013167100159186214237260320382
up‑25804798013171133170
per6244948013163119152
urinary8024948013170103127187238271326
tract1153494801314579131182220
microbiota:139849480131103127177210269332356417451503521
a19454948013161
feasibility2032494801314094145186209271295319342377430
study2488494801315289149211261
in624509801312381
patients7295098013160110142165217275307348
with11025098013179102135193
urinary1319509801315890112170219250302
stone1645509801314175131190243
disease.1912509801316082121174222262315332
Aim:774524301357098191216
To10205248013151102
investigate1147524801313188136188228263285344393425476
the16485248013142100153
putative18255248013169127161211243265315367
existence22165248013161109132171205256314363414
of2654524801316796
upper6245398013159118179233265
urinary913539801316798121179228259311
tract1249539801314274124173209
microbiota14825398013199121169201258318341399432481
and19885398013158116176
if2188539801313160
present,22725398013169101153193246305337356
to2652539801314298
compare6245548013149104194253302333385
the1033554801313087140
microbial11975548013186108156187243303325373395
communities16165548013145101190278335393414447469521561
from2201554801312558114203
the2428554801313088140
kid‑2592554801314367125158
ney6245698013159112160
with8085698013179102135193
those1025569801313492150190244
in1293569801312380
the1397569801313492145
urinary1566569801315990113170219250302
bladder.1892569801316184133192252304336350
Patients7745844013561116154181238301338385
and11815844013557119183
Methods:13875844013591148187249311376421446
Patients18565848013155103135157210268300341
were22225848013179131163214
under‑24605848013159117176229260290
going6245998013160119142200261
endoscopic9095998013162121181240281330387448471520
procedures14535998013170102160210261323380412464505
under19835998013167126186239271
anesthesia22795998013159117171212247306360400422471
for624614801312986118
upper7666148013165125185239271
urinary1061614801316596119177225257308
tract1393614801314173123172208
stones.1625614801314882138197250290310
Bladder1959614801316285134193253306337
urine2320614801316597119177230
was25746148013186136176
obtained6246298013160122156207230289343405
by10556298013170119
aseptic11996298013159100155216250273323
catheterisation,15476298013158110143203257292344377400441492526549608668687
renal2259629801314295154205228
urine25126298013168100124183238
samples624644801314293183244268322363
were10126448013188142174226
collected12636448013158115139161215266303355416
via1704644801315882131
ureteric1860644801316799152186238270293343
catheter22276448013158109142201255289341374
in‑2625644801313291125
serted624659801314194126163214274
into922659801311977109165
the1111659801313088141
renal1276659801312981139188210
pelvis15106598013157111134183206245
under17796598013155112172225256
cystoscopic2059659801314697137172228268316372433455503
and25866598013147105164
radiographic624674801313385146169229291324375437497520570
guidance.12196748013170129152213263323373426444
Pairwise16886748013166115138171255279319374
comparison20886748013158116208270321354378418478539
of2652674801316898
urine624689801315787109165216
samples863689801313785172230252303342
from1228689801312456111198
the1449689801312986137
same1609689801313685172223
individual1855689801311975132153201223280335383404
were22826898013174124154204
made25096898013185132190241
with6247048013179102135193
regard841704801313384145193225283
to1148704801313490
their1262704801313492145167198
bacteriome14847048013161111159195246278300358448501
and20097048013150108167
virome.2200704801315073104161250303321
Results:7747193013564122170233262302350376
A11827198013166
total12737198013143101135186209
of1507719801316998
nine1630719801316992151206
patients18617198013171123156179233293326369
(82255719801313991
males,237171980131101152175229271291
126877198013163
female)624734801312981170219241294319
provided967734801316193150198221280333393
both13847348013161121153211
samples1619734801314192181240263316356
for1999734801312987119
analysis.21427348013150108157179227267289328347
Nextgeneration251373480131711241722086247498013161115174229261312345368427487
sequencing11367498013150104166225279338388410469530
of1691749801316897
the18137498013143102157
V419957498013165115
hypervariable21357498013169116178234266320371403427476537561615
region624764801313386147170229288
of937764801316897
the10597648013142102156
16S12407648013163110160
rDNA14257648013141113184248
using16987648013167108130188249
primers19727648013170103126216271303345
515F23427648013162110156204
and25717648013159118178
806R2976898013154107162216
was3216898013196146186
performed3426898013157111142174232264354407467
on3917898013155114
eight405589801315071130188220
of429989801315583
them440689801313189142231
and4661898013147104164
quan‑4849898013156113162220253
titative297610480131345587136167189237288
polymerase32871048013156114137184272324355404443495
chain38051048013145101149170226
reaction4055104801312878125173208230286344
for4422104801312481112
the4557104801313087139
presence4719104801315687138177229286333383
of2976119801315885
viral308411980131456696145166
nucleic32731198013154109157178229250297
acids3593119801314592113170208
of3824119801315381
seven3928119801313688135185242
common4193119801314498185272329386
DNA46021198013166134195
viruses482011980131456696153191243282
was29761348013179129169
performed31691348013161115147179236268358411471
on36641348013160118
seven3806134801314295144196253
of4084134801315987
them.4195134801313593146235254
There44731348013152112165196248
were47451348013180132164215
no49841348013160118
significant2976149801314162121179201227253302352409441
differences3441149801316082111141193224276334382433473
in3939149801312380
alpha4043149801315073132190239
diversity4306149801316082131183214255277310361
measures46911498013191144192231288319371411
(number2976164801312983139227285338369
of3369164801315481
OTUs,34741648013169117185223241
iChao1,3738164801311980137185242286297
ACE,40591648013160118167185
Shannon42671648013147104152208265322380
and46701648013146103161
Simp‑4855164801314667154213247
son2976179801314199158
indices)3158179801312077137158207257298322
of3505179801315583
samples3612179801313888177237260313353
from3989179801312558115205
the4218179801313088141
kidney4383179801314468127185238285
and46921798013147105164
blad‑4880179801315881129189222
der29761948013160113144
from3144194801313467124214
the3382194801313997150
same3556194801314697186239
individual.3819194801312886145167216239298355404426445
Likewise,4288194801315477122173252274313366383
microbial46951948013196117166197254314337385407
communities29762098013150107198288346405427461484537578
from3579209801313771128219
the38232098013143102156
upper40032098013168128189244276
and43042098013159118178
lower4507209801313291170223255
urinary4787209801316799122181230262315
tract2976224801313465115164200
within3199224801317698131189211268
the3491224801313088141
same3656224801313787175228
individual3908224801311977136158207229288345393415
were43472248013176128159210
more45812248013186144176227
similar4832224801313859147169190239270
to2976239801313490
each30902398013155103151209
other3323239801316092150203235
than3582239801313593142199
samples3805239801314393182241264317357
within41862398013181104137195217274
the4484239801313593146
respective4655239801313385125184238288324346395447
group2976254801316091148206265
(e.g.3265254801313483100159178
all346725480131547698
kidney3589254801315175134192245292
samples).3905254801314696185244267320360385400
Viral4329254801316185116166188
nucleic45412548013163120169191244266314
acids48792548013154103125184223
were29762698013178129160210
detected32092698013155107139189237272322381
in3613269801311975
the3711269801312986138
upper38722698013154112171224254
as4149269801314584
well42562698013175125147168
as4447269801314584
lower4554269801311976153204234
urinary4811269801315484106162210240291
tract.2976284801313466116164201220
Conclusion:31262994013565125188237265327373400462525549
Upper37032998013169128188242274
urinary4001299801316293116174222254305
tracts4331299801313869119168204246
seem4601299801314598152241
to4866299801313894
be49842998013165119
inhabited2976314801312381138187247269303354414
by34143148013160107
microbial35453148013190112160191248308331379401
communities39703148013148104194283340398420453475527568
whose45623148013179137195235288
com‑48753148013148104193227
position29763298013161120160181215237294353
resembles3353329801313183123176265325348401441
that3818329801313391140172
of4014329801315886
the4124329801313391144
lower4292329801312381159211243
urinary4559329801315788111169217249300
tract.4883329801313365115164200219
KEY29783584014770134206
WORDS321035840147106190261346409
Human29763748013169127216264322
microbiome,33223748013196118167198255315337395485538555
upper39013748013164124184238269
urinary4195374801316495118175224255307
tract,4526374801314172122171207226
virome,4776374801315679110166256309326
kidney,2976389801314770130187240288301
urinary3301389801315890112170219250302
bladder.3627389801316184132192251304335350
………297641840147120240360
ÚVOD29784608018197183286388
Výzkum29764948013156105152198256344
lidského3344494801312041100139184236294352
mikrobiomu37204948013186108153186242302325382472529
–42734948013151
mikrobiálních43484948013186108153186242303325373395452474522579
po‑49514948013157116151
pulací29765098013161119141190239261
žijících326150980131537597119167189237295
v35805098013158
různých3662509801314199143202248296354
anatomických40405098013158116165197254344366414459511559617
lokalitách4681509801313190136187209231264314363421
našeho29765248013158106144196253310
těla,3309524801312979100148166
tzv.3498524801312975126139
nikách3660524801315475119169216273
–39565248013150
dosáhl40295248013155112151200256278
v43305248013145
posledních43985248013156114153174226284341362409465
dvou48865248013155103159216
dekádách29765398013160113158209269317366424
významného34245398013148100146205254343400454512570
pokroku.40185398013159118164197254300358377
Na44195398013168117
rozdíl4560539801313187130188210234
od48185398013157117
mi‑49595398013188110143
krobiomu2976554801314780136197219277367424
např.34245548013166115175206218
gastrointestinálního36665548013167116156190222279301358390441481516538596644667724746806864
traktu,4554554801314273123169206263281
jehož4859554801313184142200243
znalost29765698013145104153175234274309
již330956980131325498
významně34315698013158111158217266355414467
pokročila,39225698013169129175209266316337360409427
jsou4373569801313272130189
ostatní45865698013167107142192224283305
niky4915569801316889135187
probádané2976584801316193149210259319368425479
daleko34795848013157106128181227284
méně.37875848013188141199252268
Že40805848013157107
moč42125848013187146195
zdravých44315848013142100132182229281329386
asym‑4842584801314787136227260
ptomatických2976599801316092147236284316337385429480527584
žen3583599801314091148
není37545998013155107164185
sterilní,3963599801313670121151173195251273290
nýbrž42765998013155100160191237
obsahuje45365998013154114153203260316337389
kul‑4949599801314299121153
tivovatelné2976614801313456105161209259291342364421474
mikroorganismy34746148013186108152186242300332390438496517556644690
a41886148013146
k42586148013143
tomu4325614801313085175231
DNA45806148013168137199
desítek48036148013156109149170203254299
či2976629801314971
stovek3071629801314782138186238284
dalších,33796298013166115137176197245303321
jejichž3724629801313083105126175232276
kultivace40246298013154112134167189238288337388
je4436629801313082
problematic‑4543629801316799155216239292381429462484532559
ká2976644801314797
až30976448013155100
nemožná,32216448013163116205264306365414432
víme3677644801315578166220
od39216448013163123
roku4068644801313894140198
201142906448013159110158199
(1),4513644801313481101117
respektive4654644801313789129188242288325347396448
201629766598013154105153200
(2).3200659801313385111126
Následující33506598013174123163185238298355377399447469
práce3843659801316597147195246
prokázaly4113659801316597154200251296346369417
odlišnosti45546598013163123145167205263321361396418
ve49966598013154106
složení2976674801314164122165217276297
mikrobiomu32986748013199121166200257318341399490547
u38706748013167
různých39616748013141100144203250298356
klinických4341674801315580102160182231276329377435
situací,4800674801315071105163212262284302
např.29766898013159108167199211
u32116898013159
žen3294689801314596154
s34726898013142
urgentní3538689801315991149201259291349371
inkontinencí3933689801312481127184242274296354407465513535
ve44926898013150102
srovnání4618689801314273130178237286343365
se5007689801314295
zdravými29767048013144102134184231283373395
kontrolami33957048013153110168200232288312360449471
(3)3890704801313586111
nebo40257048013165118178237
u42867048013165
žen43757048013150102159
s45597048013147
intersticiál‑4630704801312987118169201242276298347368417439472
ní2976719801315981
cystitidou30817198013155106147181203237259318376434
ve35397198013156108
srovnání3671719801314778135183242291348370
se40657198013148101
zdravou41907198013150109140190237294352
populací45667198013167127187245267316364386
(4).4976719801313685111126
Mužský29767348013187146191234280333
močový333473480131100159210267316370
mikrobiom372873480131100123169203261323346405496
začal42497348013154106155206229
být45037348013170118156
zkoumán46847348013153101159218309359418
s29767498013141
určitým3041749801315485131152185236326
zpožděním.33917498013140100159201259311368390478497
Dosud39127498013167125165221280
byly42167498013156103126174
popsány44147498013156115175215264322367
mj.48057498013186108126
od‑49557498013154114147
lišnosti297676480131234584141199239274296
ve32967648013156107
složení3428764801314668126169220278300
mikrobiálních37527648013195117162196252313335383406463485533590
komunit43667648013153109199256314336369
u47597648013164
mužů48477648013196153197255