611
244192226014562118182
Ces8507936014570127174
Urol10497936014578115180208
2022;12827936014562121178238261
26(4):15697936014561119152209239261
242–24918557936014562119175231286343402
ORIGINÁLNÍ852207016996181224324367468561635735777
PRÁCE1667207016983165262348424
s850898013141
různou91489801312885129186244301
závažností123889801314090137186229287344384417439
symptomů170089801313785174233265320409465
dolních2188898013156113135192213260317
močových2528898013185143191246294345391448
cest850104801314897136169
(DMC)1042104801312492174234263
při1328104801315585107
benigní14571048013156108164184241297318
hyperplazii1798104801315397156209239297319366409430451
prostaty2272104801315585140179212260290340
(5)263510480131247398
nebo27561048013154105163220
u8501198013160
pacientů9361198013171124174198252313346406
s13681198013151
karcinomem14451198013157110143192215275336429484577
močového204711980131102163215273323377438499
měchýře257111980131102158209269318352405
a8501348013150
zdravými9241348013144102134184231283373395
kontrolami13431348013147104162194226282305354443465
(6).1832134801312979106121
Zatímco10001498013159109141163252301357
bakteriom13811498013162112157194245277299357447
močového18521498013191149199254303354413471
traktu2347149801313567117162199257
postup‑26281498013162121161195253313348
ně8501648013161116
odkrýváme,9911648013170133180215269325377469525543
virom1559164801316085117176269
močových185416480131102163214272323377427487
cest23661648013160113155191
je2583164801313388
takřka2697164801314495143178226279
neznámý.8501798013159112156215263352398411
Většina12851798013152103135177198255304
informací1613179801311976104161192282331379401
o20381798013154
močovém21161798013186145194249297349438
viromu257817980131456899155245302
je2904179801311972
známa8501948013144101149236284
díky1157194801315576122173
studiím1353194801313670126184205226313
na16901948013154101
pacientech18141948013156105152173225281312362410467
po23041948013156113
transplantaci2441194801312960109165203261284331387418467514535
ledviny,850209801312374132180201257301314
u11862098013153
kterých1262209801314176126156206251307
BK15922098013150102
polyomavirus17172098013155112134180236323370416437467524561
(BKV)2301209801312477129187218
způsobuje2542209801313998154191247306362383434
nefropatii8502248013160114143176234295346379402424
štěpu1299224801314985136197256
asociovanou1580224801315999158209231290339390449508567
s21722248013150
polyomavirovou22472248013169130153202260352401450473505563612670729
infekcí850239801312383112166213261284
(7).1159239801313993123139
Většina13232398013166118152195217277327
virů1675239801315983116176
obsažených18762398013168130172223269322382430479538
v24392398013160
moči252423980131100161211234
jsou2783239801313373133193
bakteriofágy8502548013161111156193244275298356384435494543
–14172548013154
viry1495254801314972103155
infikující1674254801312280105132177235257279327348
bakterie20462548013160110156193244275298350
(8),2420254801312979106121
avšak2565254801315097137187233
po‑28222548013160119154
dařilo8502698013162112145169192253
se11282698013151106
detekovat12602698013170125160213261320370422456
i17422698013132
viry1799269801316084117171
napadající19962698013169120182234296347370393443466
eukaryotní24882698013163123170223256310370404465488
buňky.8502848013161119176222273287
Z11612848013164
klinického125028480131517697155176225270322380438
hlediska1712284801316487139200222261306356
byla20922848013167114137186
přítomnost2302284801316698120153209299357415455490
po‑28162848013166125160
lyomavirů850299801312371128218267314337369427
spojena1301299801313897156179231289338
s16632998013138
rejekcí1725299801313081103156202249270
štěpu2020299801313872123182240
po22852998013157117
transplantaci2426299801313163112170210269292340398430480528550
ledviny850314801312376136186209266312
(9),1186314801313281107122
v13323148013152
ojedinělých1408314801316184136196218276329351399447504
studiích1936314801314478136195217239287344
také2304314801313786132183
s25123148013143
interstici‑2579314801312583114165197238272294342364397
ální850329801315072130151
cystitidou10253298013154104145180202235257316374432
(8)1481329801313484111
nebo16163298013163116176235
hyperaktivním18753298013163109170224256305351388410459518540629
močovým25283298013194152202257306358448
měchýřem8503448013190143192250296329380469
(10).1343344801312977124151166
Cílemprezentované1000359801316281104154240317347396438488543573626672720775826
pilotní184835980131547595150181237256
studie2126359801313668123180200250
bylo23983598013155100121177
zjistit,259735980131385979116148168200217
zda2836359801313894140
jsoumikrobiální850374801312361118174282302346378433492513560580636657
společenství1529374801313694152173225273322378416449500522
–20733748013150
bakteriom21463748013156104148183233263284340428
a25973748013145
virom–266537480131446696151239311
detekovatelná8503898013159110141190233288334382412461481537583
nejen14563898013153104124174230
v17083898013144
dolních,17743898013154110131187206252308324
ale2120389801314465115
i22583898013117
v22983898013143
horníchmočo‑23643898013153109139195215261317423479526579612
vých8504048013150101147204
cestách1077404801314595134168216264320
(HMC)1420404801312692176237266
a17094048013146
pokud17784048013157116161218276
ano,20774048013146103160176
tak2276404801313079123
zda2422404801314198146
se2591404801313789
mikro‑27034048013187108152184239273
biomy850419801316182139227272
horních11454198013158115146204225271328
a14964198013149
dolních15684198013159116138194214261318
močových19094198013189146194249296347393450
cest2382419801314898137170
liší.257541980131234381101118
SOUBOR8524608018174179278361466550
PACIENTŮ14354608018181166250286362461538638
A21074608018193
METODA223346080181122198277380482571
Prezentovaný850494801315686138183235294326382431481539586
soubor14604948013150108167227286319
tvoří1803494801314295153185208
část20354948013157107147182
pacientů22424948013169119168190243302334392
zařaze‑26584948013153104136186231283318
ných8505098013159105152210
do10845098013165123
naší12325098013164113152174
studie1430509801314681138198219272
močového17265098013196154203259307359417475
mikrobiomu,22255098013196118163196253313335393483540558
jejíž2807509801312981103125169
výsledky8505248013150103144167221282328380
byly12555248013170117141190
publikovány14705248013169128189212234280338387438496543
dříve20385248013169100123173226
(11–13).2289524801313786127177224270295310
Pacienti26245248013164113162185238297329352
podstupovali8505398013162123185225261320382442492543566589
endoskopický14645398013163122183243284331389451474524571624
operační21135398013168130185218269319379401
zákrok25395398013154106153187246293
na28575398013169119
močových8505548013190148197253301352400457
cestách,1331554801314596136170220268326343
jehož1698554801312072130188231
standardní1953554801313771121178237286317374432453
součástí2430554801313896153201251290325347
byla28005548013157104127176
katetrizace850569801314695126175207238259302351398448
HMC.13215698013164146206224
Studie1568569801314676132190211262
byla18535698013155101123170
schválena2046569801313684140186234255306363410
nemocniční24795698013154105192249297353374420476497
etickou850584801315487109158204261320
komisí11945848013155112202225264285
a15045848013158
všichni1586584801315899121169228286308
pacienti19185848013169120169191244302334357
podepsali22995848013169129190243303344394417438
před27625848013169101153214
odběrem8505998013159119178232263315404
moči12785998013190149198219
informovaný1521599801312381109166198288346394444502548
souhlas.2093599801314199157215237286326345
Předoperační1000614801315789142205265328384417469519579602
kultivace16286148013156117140175198249301352405
moči205861480131102162214237
byla23206148013171120145195
(s2541614801313878
jednou2645614801313387150210271331
výjimkou8506298013149101123144232277333390
pacienta12636298013157106154175227284315364
č.1650629801314563
6)1737629801314975
negativní.18366298013154106166214245267315373395412
Antibiotická22726298013160117148170228250307339361408453503
pro‑2798629801315788144178
fylaxe850644801312981105153201252
byla11266448013161109132180
(opět1331644801312984144198231
s15866448013141
jednou1651644801312477137195253311
výjimkou19866448013150102125147236281338396
pacienta24066448013161111160181234292324373
č.2803644801315069
2)2896644801315480
podávána8506598013160119179227274324381429
až1303659801314690
po14166598013157116
odběru15556598013155114173227258315
obou18946598013154114173230
vzorků2148659801314692148179225282
moči.24546598013186144192214232
Žádný27106598013155104163220266
ze850674801314699
subjektů9756748013150109171195249297335395
studie1396674801315086146208231286
neměl17076748013170125217272296
v20286748013160
močových211367480131101162213271322376425485
cestách26246748013159112154190241292352
zavedeno850689801314596144196257311369428
cizí1303689801315779124146
těleso,1474689801314294116170210269286
např.17856898013167117177209221
stent2030689801315085136195227
nebo22816898013168122182242
močovou25476898013199158208264313370429
cévku.8507048013149100149195253272
Vzorek10007198013156100156188240285
moči13107198013196155204226
z15607198013151
močového16357198013197155204260308360418477
měchýře,21367198013197150199257303335386403
resp.2563719801313991131190208
dol‑27957198013167125148181
ních850734801315879126183
močových10567348013185142190245292343390446
cest1526734801314494133167
(DMC)1716734801312594177238267
byl20067348013156103125
odebrán21547348013154113165224255304360
po25387348013156114
zarouš‑2675734801314090120175232270301
kování,8507498013147103152201259281299
dezinfekci11737498013158111156178236263316361408430
genitálu16277498013158111169191224274296353
a20047498013149
zavedení2077749801314293141193253306364385
cystoskopu2486749801314899139174230270315372432490
s8507648013142
použitím9187648013173135196242266301325418
lubrikačního1361764801313595157191215262316367427450513574
gelu19617648013172128152211
bez21987648013173130177
mikrobicidní240176480131103127174209269331356406430491552575
příměsi.320389801316193115205258298320338
Poté3565898013164120152204
byl3793898013169116140
měchýř3957898013198152201259305338
naplněn4319898013167116176200257310368
fyziologickým471289801313789136159217240298359381429475527617
roztokem3203104801313288130167223268320408
a36351048013146
do37051048013155113
předpokládané3842104801315788139199258317363387435494542600652
oblasti45181048013155114137185225259281
renální4823104801312879137185207264286
pán‑51321048013157107164197
vičky3203119801315073121166217
zavedena34441198013150101149201261314372421
738891198013159
F39721198013146
ureterální4042119801316496147180231263312335392414
cévka;44801198013155106154201251269
později47731198013166125168226278300322
jsme5119119801312968157210
používali32031348013160118175218239287336358378
703605134801314997
cmmono‑J37261348013143130238296353410444474
stenty.4224134801313670119176207257270
Moč45171348013181138186
byla47271348013155101124171
odebrána49221348013154113164223254303359407
samospádem3203149801314293184244285345396457511602
odkapáním38301498013168130176228289340399422512
do43671498013170129
připravené45211498013170103126187220271319373432486
sterilní5032149801315086138170193216275297
zkumavky3203164801314490149237286334380432
v36591648013157
množství37401648013198156214257299334386409
5–5041731648013161116168219
ml.44161648013186108126
Z45661648013167
provozních46571648013169101157205262305363385433491
dů‑51721648013167124157
vodů32031798013150107167224
netrval34511798013156109142174227277299
žádný3774179801314292152209255
odběr40531798013156116176230261
déle43381798013157110133185
než45471798013157110154
104725179801315198
minut.48471798013187109167224257276
Oba51471798013171132182
vzorky3203194801315097154187233285
byly35131948013169116140188
uloženy3726194801316789148191243301348
při40981948013169101124
442461948013162
°C4333194801312891
a44491948013158
týž4531194801314394141
den46971948013168121180
zmrazeny49011948013153144175226271323381428
a32032098013150
poté32772098013161120152203
uchovány35042098013159107165223272321379425
při3953209801316193115
-204092209801313379131
°C4247209801312890
až4361209801315095
do44802098013160118
extrakce46222098013153101137169219264312362
DNA.50082098013172141204226
K33532248013155
izolaci3431224801312063119142191239260
DNA37152248013168137199
byl39382248013157104127
použit40892248013157116173217239272
Eligene438522480131476990149202259312
Urine4721224801316595118175228
Isolation4973224801311958116139187219241298356
Kit3203239801315580114
(Elisabeth3341239801313889111133173224284339373432
Pharmacon,37972398013164122171203295344394450510528
Brno,4350239801316496156215233
ČR)46072398013172127155
dle4786239801316992145
instrukcí4956239801313190130165197257303351373
výrobce.32032548013150102134191251301352369
Hypervariabilní35962548013171119180234265318368399422470530552574632653
region4273254801313486146168226284
V445812548013158108
genu47132548013161114172229
pro4966254801316395151
bak‑51412548013163113158188
teriální3203269801313485116139187209267289
16S3516269801315097145
rRNA3685269801313084154217
byl39262698013158105128
amplifikován40782698013147136195219240266293338394443493550
polymerázovou46522698013158117140188278332363413457514562619677
řetězovou3203284801313284117168212268317374432
reakcí3659284801313688136181228250
s39332848013145
primery4002284801316496119208261292344
51543702848013158104149
F45432848013146
a46132848013154
806R46912848013157111165219
v49342848013154
krocích5012284801315083140190211259317
popsaných32032998013161120181221272330376424482
dříve37092998013169100122172224
(11).3957299801313886127147162
Po41432998013164120
vytvoření42872998013158110148201258290342400422
sekvenačních47332998013149103149202254312361410468490538596
knihoven32033148013147106128186244292344402
pomocí36293148013167126215274323345
nástroje39983148013165114153188220276299351
TruSeq4373314801315782140189243303
DNA47003148013177146209
PCR‑Free49333148013161123177210262291342396
LP32033298013149102
Kit3328329801315073105
byla34563298013156102124172
DNA36513298013166134195
sekvenována3869329801313789133184235291348395444500548
na44403298013154101
platformě4565329801315578125156187242273361413
Illumina500132980131194061117204225281328
MiSeq32033448013186108157210270
2×25034973448013154119172225277
bazí37983448013161110155178
(Illumina40003448013129517394151240262319368
Inc.,4392344801312381130149167
San45833448013151101159
Diego,4766344801317193146206264281
USA).50713448013169117179207222
Sekvenční33533598013152106153207260320369429451
data38293598013169119152203
byla40573598013170119143192
analyzována42743598013160119169192241289347396447506556
postupem48553598013171131172208267328383474
popsaným32033748013162123184226277337384476
dříve37043748013170102125176229
(12).3958374801313887133160176
Po41593748013164121
vypuštění43053748013159113175235275311363422445
dat47753748013169119152
s49523748013151
nízkou5028374801316891136183241301
kvalitou3203389801314799149171193226282340
byly35673898013166113136184
sekvence3775389801314699145198249307356407
seskupeny4206389801314699139184242302356414460
do46903898013164122
operačních48363898013164124178209259308366387435493
taxonomických3203404801313483131187245303392414462507558606663
jednotek3890404801312072132190248280331376
(OTU)4290404801312596144213241
na45554048013155103
úrovni4682404801315586142190249270
97%4976404801315099178
po‑51784048013157116151
dobnosti,32034198013159117176234291331365386404
což36304198013145100142
odpovídá37964198013154114172231278301359407
bakteriálnímu42274198013156105150186237268290337359416437525581
druhu.4832419801315586144201257275
Ana‑51314198013160117165198
lýza3203434801312370115165
alfa339143480131456694143
a35574348013145
beta36254348013156109141189
diverzity3837434801315576124175205250272304354
byla42154348013155101124171
provedena4409434801315687142189240299350407454
v48864348013145
prostředí4954434801315687142181215245295354375
R32034498013156
4.3283449801316179
2.3386449801316178
034894498013161
(14)3574449801313684130156
pomocí37544498013168127217275325346
balíčku41244498013169119141162210255313
vegan44614498013157109170218276
2.6-24761449801316179133168214
(15).4999449801313784129156171
Byl51944498013163112135
spočítán32034648013141100159209230264313371
počet35984648013166125174225258
OTU38804648013179128197
reprezentujících4101464801313889149181232277329386418476498520568589637695
9548204648013159111
%49554648013186
celko‑50654648013154105127172229264
vé32034798013150102
bakteriální33294798013165114160197248279302350372430451
komunity38044798013151108198255312334368419
v42474798013154
každém43254798013151101146204257346
vzorku,46954798013154100157189235293311
iChao15030479801312789147196254299
(16),3203494801312977124150166
ACE33934948013173133183
(abundance‑based3600494801313783143202260320369427476527561623673713766827
coverage44514948013157114162214246296356409
estimator)48844948013162102137159248298330386418445
(17),3203509801313080125156172
Shannonův34015098013161121172232292353413473524
a39515098013160
Simpsonův4036509801316184176238280340401460512
index.4573509801313292154209259280
Průměrná4879509801316597158250305338399450
hodnota32035248013160120181241300334384
rozdílnosti36125248013142100143203225250309369410446468
pro41055248013170103161
jednotlivé4291524801313387148207267300324346396450
skupiny4765524801315197156217240299347
byla51375248013170118142192
spočítána32035398013141100159209230264313371420
na36475398013156105
základě3776539801314292138162211270323
Bray-Curtis4123539801315384134181213279334365402425464
distanční4611539801315779118152202259308366387
matice.50225398013188137169191239290307
Statistické3203554801315182132164186225259282330375427
rozdíly3654554801312985127185207232280
byly39585548013157104127175
považovány41575548013157117165215259315364414471517
za4698554801314192
signifikantní4814554801313759118175197223250295346403435493515
na32035698013159108
úrovni3335569801315890146194253275
p36345698013161
<37195698013165
0,05.3809569801315370124176192
Integrita3353584801312380110160219249270302350
izolované3726584801311861116138194241290346398
DNA41475848013166134196
a43665848013145
přítomnost4434584801315586107139194282338395434467
inhibitorů4924584801311874131151209231263317348405
byla32035998013161107129176
ověřena34025998013163110161190240297344
amplifikací37695998013154142201223243268294338388436456
kontrolního42485998013151106164194225280302359379438495
genu47665998013164116173229
pro5018599801316495151
lid‑5192599801312747105137
ský3203614801314185135
beta33616148013167120152200
globin3584614801316687143203224280
(18).3887614801313582127152166
Poté40766148013161115147197
byla42966148013166112134182
provedena4501614801316697152200250309361418466
detekce49906148013165117149199243289339
BKV,32036298013156109167178
JC34046298013142104
polyomaviru35316298013165123145192248337384431453483540
(JCV),4094629801313470131189220235
torque‑teno4352629801313994124181237289322354404461518
viru4893629801315576107164
(TTV),5080629801313487143203235249
viru3203644801315174106166
Epsteina‑Barrové33936448013160121161197249271330379413471522554587645694747
(EBV),4164644801313888143199232248
lidského4436644801313254114154200253312372
cytomega‑48326448013158110148205297352413463497
loviru3203659801312483132155187246
(HCMV)34746598013137106170257312346
a38446598013159
adenovirů39276598013159120173233292341364396455
pomocí44066598013170130222282332354
kvantitativní47846598013156109160219251274307358390413463523545
PCR32036748013156118172
(qPCR),3398674801313793147209263290305
HPV37266748013178132188
byly39376748013169116139187
identifikovány4147674801313190143200232253279306351408456505563609
pomocí47806748013168127218276325346
PCR51506748013163125179
s32036898013141
následnou32676898013154102140161213272329386443
reverzní3733689801312778125176206251309330
hybridizací40856898013155100159190211269290333382430451
na45596898013154101
membráně.46836898013186138226284315364420472488
Pro5194689801315080135
jednotlivé3203704801312477137195253285307328378430
qPCR36567048013168122184238
byly39187048013169116139187
použity41287048013169128186230252285337
již448870480131315396
publikované46087048013169127187209230275332381430488541
pri‑51737048013169101123156
mery32037198013190142172223
a34497198013156
hydrolyzační35287198013165110167197253275322367417464521541
próby4092719801316798153213259
značené43747198013150108155202252309361
fluorescenční4758719801313259115172203253292340390446494550571
barvou32037348013161111142194251309
FAM35357348013159116201
na37607348013166115
5’3898734801316276
konci39977348013155111169218239
a42597348013158
zhášečem43407348013152111159198251300350439
BHQ-148037348013163131205240286
na51127348013167115
3’5251734801316178
konci.32037498013147103160208229246
Seznam34737498013158110154212259348
všech3844749801315796148197253
primerů4121749801316798120208260291348
a44927498013157
prób4572749801316899155214
je4809749801313183
k49157498013154
dispozi‑4992749801316787126184242284305337
ci3203764801314970
u32967648013166
korespondujícího33857648013154110141192231289348406464520542562610630690747
autora41557648013157114146202233282
na44607648013166114
vyžádání.45977648013157109154204263311368388406
Reakce50267648013162115162207253303